La historia detrás del nombre de La Habana está envuelta en leyendas, raíces indígenas y evoluciones lingüísticas. Aunque existen varias teorías, la más aceptada señala que el nombre proviene del cacique Habaguanex, un líder taíno que gobernaba la región donde se fundó el primer asentamiento español.
Habaguanex 是古巴西部土著人民中一个有影响力的人物，他的名字被殖民者用来命名1514年建立并于1519年迁至现址的小镇。
这一假设得到了多位历史学家的认可，例如已故的Eusebio Leal，并直接将这座城市的身份与其泰诺族根源联系起来。
其他较少被接受的版本建议，“Habana”可能源自泰诺语中的单词sabana，在阿拉瓦克方言中发音为jabana。
也有人支持哈瓦那源于德语根源的观点，因为“haven”意为“港口”。此外，还有一种源于阿瓦克语的传奇解释，其中“abana”意指“她疯了”，并提到一位名叫 Guara 的印第安女性。
关于名称的书写形式，古巴历史学家 Emilio Roig de Leuchsenring 记录了在两个多世纪的时间里，写作 Havana 或 Hauana 是很常见的，这在 Cabildo 的书籍和巴托洛梅·德·拉斯·卡萨斯的 Brevísima relación de la destrucción de las Indias 等作品中均可见。
从1798年起，古巴的文献中逐渐开始使用“b”代替“v”来书写哈瓦那，虽然直到1821年这种写法才完全巩固下来，彻底取代了之前的形式。
超越书写，哈瓦那这个名字在其根源中保留了土著记忆，哈巴瓜内克斯作为古老历史的象征，依然在古巴首都的身份中延续。
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